明天启五年公元1625年后金6千兵开始反扑旅顺卫的明东江总兵军队，导致明金州卫游击：张盘、明金州卫参将：朱国昌，等将领战死！后金又重新占领旅顺卫。
随后明辽东督师任明三屯营总兵：马世龙，为山海卫总兵留守卫城就遇到了（弃暗投明）的秀才：刘伯镪，从后金归来山海卫他自称广宁中屯卫的后金守军不足3百人可以拿下？
于是明山海卫总兵：马世龙，就信了他立刻调明前锋营副总兵：鲁之甲、明前锋营参将：李承先，领兵过河但明水军游击：金冠，等将领的大船没到就过河！只能坐小渔船往返载多人，此举很快让后金兵发觉并埋伏袭击明军败退，导致马世龙被撤职而孙承宗也遭连累。
随后明熹宗就让明兵部尚书：高第，任辽东经略他是明东厂提督：魏忠贤，的党羽刚上任就把广宁中卫、广宁右屯卫等地明军调入山海卫里只留明广宁前屯卫兵备佥事的2万明军驻守宁远卫，就遇到努尔哈赤率兵进攻宁远卫。
接着明东江总兵立即派明鹿岛参将：林茂春、明宽奠营参将：王辅，率军进攻海州卫又派明后营参将：杜贵、明镇武营游击：曲承恩，一共1万2千人直入沈阳中卫（后金新都城），并且行动极为迅速一举拿下沈阳中卫防守又攻得海州卫。
此时努尔哈赤在宁远卫城下仅仅待了两天就急忙撤军回救，明广宁前屯卫兵备佥事也出击攻打努尔哈赤的后军二旗，明军大胜杀敌1千人（明广宁前屯卫兵备佥事：袁崇焕）被封广宁前屯卫兵备副使，在明军撤退时明广宁前屯卫兵备副使：袁崇焕，又负责在后队打掩护有功加封宁远卫右参政。
明宁远卫右参政：袁崇焕，上奏说道“东江总兵袭击辽阳卫，又与后金军对战解救宁远卫之围实乃有功之臣。”此举得到朝中大臣们的赏识。
明天启六年公元1626年因后金地区又发生了灾荒，这次后金天命汗率兵13万南下广宁中屯卫、松山堡、大小凌河、杏山堡、连山堡和塔山卫7城，进而再次围攻宁远卫并传信明宁远卫右参政要他投降。
在后金大军压境又无大明援军的紧急关头，明宁远卫右参政毫不畏惧他和明宁远卫指挥佥事：满桂、明宁远卫指挥使：朱梅、明宁远卫参将：祖大寿，等集合将士2万人固守宁远卫。
见到后金军来攻城时明宁远卫右参政有些紧张，就架起了11门〈红衣大炮〉开火轰炸，使得后金战败被炸退三次进攻，在宁远卫城下战死1万7千后金骑兵，就连后金天命汗也被开花炮弹击中一炮被迫下令撤军，改去攻打东面觉华岛的东江总兵明军。
当时明觉华岛参将：姚抚民，正在率明军开凿15里冰道，突然遭遇后金天命汗与漠南蒙古内喀尔喀部巴约特酋长：博尔济吉特·恩格德尔，和太师：博尔济吉特·武讷格，以巴约特蒙古骑兵配合后金骑兵进攻明军兵败觉华岛！
明觉华岛把总：金冠，战死而他的长子明武举：金士麟，就带8百明军救援不幸被围一共战死觉华岛军民1万4千人！其中明东江总兵还在后金敌后东宁卫开战，在得知觉华岛消息后才撤军史称〖宁远卫之战〗，明军虽胜利稳固了大明宁广防线，但是东边的觉华岛基地却被彻底摧毁！
之后明东江总兵退守铁山，而后金天命汗以攻打觉华岛时巴约特部蒙古不出力为由，发兵打到西拉木轮时就遇到漠南蒙古察哈尔部：林丹汗，又得知明东江总兵在进攻鞍山堡才撤军回来盛京，就见到漠南蒙古科尔沁部王子：博尔济吉特·奥巴，前来归顺后来努尔哈赤旧伤复发便前往清河堡汤泉城养伤，可由于病情严重只好乘船从太子河返回盛京途中病死葬在（福陵）。
同时明辽东经略：高第，由于宁远卫之战压力太大承受不了，就奏报陛下撤职被准，明熹宗就封袁崇焕为辽东巡抚兼兵部右侍郎。
之后京城的魏忠贤还自称（九千岁），并把为范慧妃求情的李成妃给陷害，让明熹宗把她给关起来还好她聪明藏有粮食吃没死，半个月后明九千岁：魏忠贤，得知消息后大惊失色以为有仙人相助不敢得罪，就让上奏让明熹宗把她放了。
导致皇帝身边的后宫佳丽就只剩下明九千岁的侄女：任容妃，成为了明熹宗传宠美人，今后大明帝位也就属于明皇三子：朱慈炅，但好景不长？
在5月巳时王恭厂突然发生大震，在一声天崩地塌的巨响之后昏黑如夜的京师城内，燃起了大火东至顺城门大街、北至刑部街火势传十三里附近街道全部化为灰烬。
明天启七年公元1627年明熹宗召集吏、户、礼、兵、五部尚书说道“朕之皇五弟：信亲王已年长其岁禄爱万石，今居京城先给米3千石钞万贯，等归封地后米全支并选王府官员，现在京先给校尉3百、仪卫1百。”圣旨发布之后明信惠亲王：朱由检，在京很受皇兄的宠爱。
另外明辽东巡抚：袁崇焕，与明宁远卫总兵：满桂，不合！明辽东巡抚就请他移军别处，最后明宁远卫总兵被召回京明熹宗改派明蓟辽督师：王之臣，代替高第为（辽东经略）。
好在明辽东经略：王之臣，上奏熹宗留满桂去协助明山海卫总兵：杨麟，一起镇守，但明辽东巡抚却反对此举，无奈朝廷商议命明辽东经略督师关内明军、明辽东巡抚督师关外明军，划关而守但之后又召明辽东经略回京，由明九千岁派明监军太监：刘应坤，去宁远卫并传旨辽东都司关内外所有军事全权由明辽东巡抚处理，而在京城的王之臣则被加封为（太子太保）
此时后金天聪汗：爱新觉罗·皇太极，改元年号（天聪），随后派出后金和硕二贝勒：爱新觉罗·阿敏、后金和硕五贝勒：爱新觉罗·济尔哈朗，率3万铁骑渡过鸭绿江后金和硕二贝勒攻占李氏朝鲜平安西道义州、后金和硕五贝勒则率大军进攻东江明军镇守的铁山，还把明军打退到了皮岛。
后金和硕二贝勒认为皮岛隔海相望又没有水师无法进攻，而义州则容易被攻取所以他认为李氏朝鲜防御力较弱足以取胜，因此后金把进攻目标转为李氏朝鲜。
两路后金军大举南下放兵四处劫掠、另一面又派使者去向李氏朝鲜元宗纯孝郡王：李倧，议和得知后金大军南下而各路援军不敢前来！的消息李氏朝鲜元宗郡王惊恐万状，连忙将后妃送到江华岛避难。
接着明东江总兵与李氏朝鲜双方奏朝廷，明熹宗就派明军前来支援，就在朝廷兵部让明辽东巡抚发兵救援时，明辽东巡抚却以兵力不足粮草不够等原因迟迟不发！后金又派使者与明辽东巡抚议和，刚好他也想利用议和来拖住后金。
于是后金二贝勒趁机进军先后攻占安州郡、平壤府直到黄海道才停止进攻，并安营扎寨双方进行一个月的谈判，李氏朝鲜迫于后金军事压力基本答应后金提出的［送质子、纳贡、去大明年号尊后金年号、结盟宣誓、约为兄弟之国，但不剃发易服］史称〈丁卯胡乱〉。
不久后金南四卫副将：刘兴祚，重归大明他向明东江总兵献计说道“毛总兵大人，我兄弟亲族都在萨尔浒城中可当作内应，请速派大军前来。”而萨尔浒城位于后金大后方是屯积粮草区，明东江总兵就调明登州卫参将：耿仲明，率军千里夜袭一看见后金哨兵就掩杀，抵达萨尔浒城时还派细作入城暗通城中刘兴祚之弟：刘兴贤、刘兴治，两人里应外合一举攻破城池，明登州卫参将入城之后就对城中的八旗军大开杀戒斩首3千人、俘虏69人与刘氏兄弟胜利还师。
以前后金叛明攻打大明城池时，都是依靠奸细内应入城之后往往城，而这次换了大明东江军「萨尔浒大捷」，也用了后金的方案攻城，同时明东江总兵也学后金开始鼓励辽民做奸细扰乱八旗军，又故意写信给后金将领让皇太极怀疑自相残杀。
而皇太极心虚就遣使往东江镇议和，明东江总兵也将计就计要皇太极派重要官员前来谈判，明东江总兵为了表示忠于大明天子，他特意把书信交给明熹宗观看，还说出自己的诱敌之计让明熹宗决定是否放还后金使者？
不知情的皇太极就派后金固山额真及3名牛录到东江镇，当场就被明东江总兵给绑了送往京师，使得皇太极得知气急败坏致书大骂明东江总兵不讲信用。
之后明东江总兵又多次以归顺后金为诱饵，甚至还写信提出“你皇太极取山海卫、我毛文龙取山东承宣布政司。”等诱敌书信并奏报朝廷给明熹宗观看，明熹宗虽然有些生气但看在是诱敌方略所以忍了，不过皇太极进军山海卫途中就遭到了明军伏击大败而逃，从此皇太极再也不敢相信明东江总兵了。