朱元璋是第一位出身社会最底层，以及江湖会党的开国帝王，因此朱元璋的修养和城府非常独特，无人能及，他精通人神之道，通晓阴阳谋略，善于玩弄黑白社党。因此，朱元璋对于自己死后的国家形势变化计算周密，样样逼真。
朱元璋在重病期间，他将自己对国家的忧虑和对策全盘告诉了他的继任者朱允炆。
朱元璋一直认为自己那些儿子，特别是那几个封疆藩王对朱元璋、朱允炆和朝廷非常不满。因为明军西征的事情，朱元璋与封疆藩王们已经闹翻，因此朱元璋还能正常工作时，就与朝廷内阁大臣们谋划削藩的事情，给朱允炆登记创造一个良好环境，但是朱元璋病倒后，此事不得不搁置。
朱元璋是具有科学头脑、心思缜密的人，他通过削藩试探摸底和情报调研，朱元璋知道燕王朱棣对削藩反映最强烈，因为朱棣接到朱元璋打算削藩的试探情报后，朱棣马上更换了朝廷派去暗中监视自己的燕国官员，同时派出使节去联系蒙古人和女真人，要求他们帮助朱棣推翻朱元璋和朱允炆，而且朱棣还经常在别人面前将自己比做唐太宗李世民，李世民就是推翻唐朝开国皇帝李渊和皇太子李元霸成上位的。蒙古人和女真人本来就想重返中国，因此他们答应朱棣，愿意出兵帮助朱棣成就大业。
朱允炆听了朱元璋陈述后，他惊恐得脸色苍白，瑟瑟发抖，冷汗直冒！
朱元璋已经自己病倒，不可能带兵抵抗朱棣，他还知道朱允炆不是朱棣的对手，第一，此时朱棣已经38岁的中年人（朱棣生于1360年5月2日），他经营燕国已经十多年，而且多次带兵深入北方大漠剿灭蒙古残余，同时带兵平定了东北地区女真族的多次叛乱，朱棣在治国和军事方面的阅历和经验都在朱允炆之上。第二，由于建国初期，朱元璋能打仗、会计谋的人才都杀光了，因此朱元璋的朝廷里没有人能够帮朱元文打仗。而朱棣常年受到蒙古人和女真人的军事威胁，因此朱棣首先的战将和谋士多如牛毛，而且这些军事人才都已经通过实战历练。第三，朱棣确实跟蒙古人和女真人有秘密协定，朱棣有可怕的帮手。因此，如果朱棣起兵反叛，朱元璋和朱允炆肯定被推翻！
朱元璋气愤瞪着哭成泪人的朱允炆说：允儿！你就当皇帝了！遇到问题不能哭，要想对策！否则，往后你连哭的机会都没有了！
朱元文收起哭声，擦干泪水，对朱元璋默默点头。
于是，朱元璋将自己对策全盘托出，朱元璋说：允儿！朱棣随时都可能打到南京来！既然我们打不过朱棣，我们就要准备逃跑！
朱元文点头说：爷爷！我们跑去哪里？
朱元璋说：去欧洲，我们要在欧洲重新建立明朝，并最终消灭朱棣和蒙古。
朱元文说：爷爷，我们怎么去欧洲？
朱元璋说：从北海走，我们要在海牙和伦敦登陆，在英伦三岛秘密建国，然后，通过明军、锦衣卫、洪门、共济会和光明会等手段统治欧洲和美洲，以及全世界。但是为了掩人耳目，在我们走北海之前，我们让一部分人朝廷官员及臣民逃亡南洋，这样即使朱棣知道我们逃跑，他只会去南洋找我们，这样能为我们赢得逃跑和秘密建国的时间。
朱允炆笑着说：太好了！爷爷，我们走时，将朝廷和民间的船全部带走，带不走的船和物资都全部毁掉！这样朱棣就算要追我们，也没有船！他们总不可能游泳去追我们吧！
朱元璋强忍病痛，欣慰地笑着说：允儿啊！你懂事了！做人做事要跟下棋一样，多想几步棋，这样我们才不会输！允儿！能带走的人和物，我们必须带走，带不走的要全部毁掉，我们不能给朱棣这个乱臣贼子留一点有用的东西。
于是，朱元璋给朱元文列举了要带走人物清单。
随行人员有：随行的皇亲国戚名单；随行的朝廷文武百官名单；随行科学家、技师和工匠等人才；随行后宫及其太监、明军、锦衣卫、洪门等人员名单。共计10万多人。
随行物品有：皇家家具及生活用品；朝廷天文台全套观测及计算仪器，以及天文及历法书籍；蒸汽机、船舶、火炮、枪械等关键技术的样品、图纸及书籍；航海仪器包括指南针、精密机械时钟、测速器等精密仪器及航海图，世界地理全图；朝廷图书馆的全部图书，以及国家文史档案馆的全部文件和卷宗；朝廷各部门的档案及账本；朝廷金库的现金及账本；朝廷储备的绫罗绸缎、金银珠宝、古董玉器，以及粮食、干菜、腊肉、食用油等生活物资。
准备安装蒸汽机及火炮的战舰200艘、运兵船200艘、货船100艘等船舶。
朱允炆要秘书记录好上述清单后，他询问朱元璋：爷爷！我们在中亚驻扎的50多万西征军怎么办？
朱元璋笑着说：喔！你不说我都差点忘了！允儿！根据欧洲发来的情报，目前我们在欧洲的远征军已经与俄罗斯结盟，我军正在帮助俄军升级武器，并指导俄军对蒙古作战。目前蒙古已经分裂为鞑靼和瓦剌等两个阵营，鞑靼主要盘踞中亚东北到黑海西岸及第聂伯河流域地区，瓦剌盘踞在中国北方草原和西伯利亚贝尔加湖一带。
目前鞑靼和瓦剌为争夺蒙古正统和地盘正在打得不可开交，因此中亚地区成为鞑靼和瓦剌阵营的战争缓冲地带。我欧洲远征军提议，我中亚西征军可以往欧洲撤退，已补充我军在欧洲驻军数量不足的问题，他们将联合俄军到中亚接应我中亚西征军。这样，我西征军就可以安全撤退到欧洲驻扎！
允儿！我们就按照欧洲远征军的建议办！同时，你马上让朝廷给中亚的西征军调拨50万工匠和劳役，就说朝廷要在中亚搞经济建设！然后，让西征军将这50万工匠和劳役带到欧洲，这样我们欧洲干活就不缺人手了！
皇帝搬家是一件非常保密、复杂而庞大的事情！
朱元璋给朱允炆交代完事情后，朱允炆就忙着去办事了！
朱元璋本来认为自己身体还能够支撑几年，能够跟朱允炆去欧洲，帮朱允炆打开欧洲的局面，因为他觉得朱允炆太年轻了，担心他把控不了国家大局。
但是，朱元璋没有想到，朱允炆刚刚启动搬家计划，自己就去世了！
朱元璋去世发丧几天后，朱允炆登基称帝！
朱允炆登基几天后，朱棣就在燕京起兵反叛。
由于明朝廷有防范朱棣作乱的准备，因此朱棣军刚出天津准备南下就遭到明军的奋力抵抗。
朱棣于1398年7月初起兵南下攻打南京，由于朱允炆要张罗明朝搬家的事情，因此明军对朱棣军的抵抗非常顽强，使朱棣军寸步难行。
由于朱元璋生前心愿是要跟朱元文一起去欧洲，加上朱元文担心朱棣对朱元璋的尸骨不敬，因此朱允炆按照拜火教的规矩给朱元璋做了火葬，并将朱元璋的骨灰装坛，准备带去欧洲安葬。随后，朱元文便忙着落实搬家的各项事宜。
随着明朝搬家的事情件件落实到位，明朝廷通过更换明军主帅的方式让朱棣军逐步南下。
一切搬家事项都全部落实后，朱允炆召见锦衣卫和洪门的潜伏人员的头目，给他们授予印章、接头信物和暗语等，国内潜伏组织与海外锦衣卫和洪门的联络方式，同时给他们下达潜伏任务。锦衣卫和洪门是朱元璋留给朱允炆最宝贵的遗产，朱允炆到达欧洲，洪门控制的共济会和光明会将成为朱允炆统治欧洲和美洲的重要手段。
散落民间的明朝廷史官文献记录，在朱棣军进入南京城前三个月，200多艘战舰、运兵200多艘船、100多艘货船停靠在南京长江军港码头，他们利用晚上不停地往这些船上搬运各种物品和物资，装运大批穿着各种平民服装和携带器械的人员，但这些人的体态和气质不像平民，很像官员、军人和文人。连续这样装运了几个晚上，在一个晚上，最后一批人上船后，这支庞大的舰队起航，向长江出海口全速驶去！
建文四年六月（1402年7月），燕王朱棣率领燕军，攻到了南京，这时，谷王朱橞和李景隆叛变了，打开了金川门，迎接朱棣大军进城，朱棣就这样攻进了京师南京。
朱棣进城后看到，整个南京城各地房子都在燃烧，王宫区域火势最大，朱棣带领部队进城的道路两旁挤满了下跪哭啼的人群，在道路两旁的树上和屋檐下挂满了，害怕被朱棣清算而上吊自尽朝廷官员和后官佳丽及宦官！
朱棣进入王城后宫大殿广场后，后宫太监们搬来三具已经烧焦的尸体，主管太监对朱棣说：这是朱允炆、皇后和皇太子的尸体。
当时，朱棣军看到整个皇城和皇宫已经烧成残檐断壁，找不到一个会说话的朝廷官员，也找不到一件有用的东西，朱棣想，这不是搬家逃跑才有的样子吗？！
朱棣知道这些太监在骗他，但是为了自己能够顺利登记称帝，只能哭着呼喊：贤侄啊！我朱棣只是来“清君侧”，并不想伤害你啊，你为什么要自寻短见啊？！
几天后，朱棣在南京城的废墟上登基称帝，称为明成祖，年号永乐。
朱元璋号称明太祖，说明朱元璋是明朝的开国皇帝，而朱棣也称自己为祖，说明朱元璋和朱允炆没有给他留下任何有用的东西，明朝要靠他重新再来！
当然，朱棣和明朝的麻烦事从此开始了！